卡罗拉双擎的故障率相对来说并不高，大部分问题都集中在使用体验上。

在2019款卡罗拉双擎版的投诉中，变速箱异响顿挫问题较突出，特别是在低速行驶时更为明显。也有部分2018款车型的自动大灯模块故障率偏高，主要表现在照射高度不准和自动大灯光速偏高，这对于行车安全无疑构成了潜在的威胁。

卡罗拉双擎的电池组采用的是镍氢材料，厂家为其提供了8年或20万公里的质保。然而，对于镍氢自然老化导致的性能下降，厂家并不提供保修服务。这也是使用纯电动模式时，车辆续航里程少、使用寿命短、维修费用高的原因之一。更换电池价格要几万元，这也是用户表示卡罗拉双擎修不起的原因之一。

在噪音方面，卡罗拉双擎的怠速噪音控制得较好，但当车速达到60km/h以上时，噪音就比较明显了。